Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim28Q62318 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim28Q62318 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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