Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms