Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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