Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctr9Q62018 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms