Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
AtrxQ61687 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms