Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trim25Q61510 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim25Q61510 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim25Q61510 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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