Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms