Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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PtprnQ60673 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PtprnQ60673 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms