Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms