Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tsr1Q5SWD9 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tsr1Q5SWD9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tsr1Q5SWD9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tsr1Q5SWD9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tsr1Q5SWD9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tsr1Q5SWD9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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