Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Trim58Q5NCC9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Trim58Q5NCC9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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