Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms