Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms