Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms