Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms