Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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