Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ap5b1Q3TAP4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ap5b1Q3TAP4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ap5b1Q3TAP4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ap5b1Q3TAP4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ap5b1Q3TAP4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ap5b1Q3TAP4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ap5b1Q3TAP4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ap5b1Q3TAP4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ap5b1Q3TAP4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ap5b1Q3TAP4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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