Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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