Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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