Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Edem3Q2HXL6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Edem3Q2HXL6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms