Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ptcd3Q14C51 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ptcd3Q14C51 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ptcd3Q14C51 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ptcd3Q14C51 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms