Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms