Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms