Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata18Q0P557 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms