Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms