Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms