Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms