Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms