Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms