Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gjb5Q02739 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms