Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai1Q02085 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai1Q02085 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms