Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mc1rQ01727 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms