Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Scn1bP97952 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms