Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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