Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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SgcdP82347 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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