Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Irx1P81068 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Irx1P81068 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Irx1P81068 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms