Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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