Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hoxd13P70217 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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