Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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