Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NcanP55066 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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NcanP55066 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcanP55066 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms