Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbrP50284 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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