Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms