Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtpreP49446 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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