Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp4P35123 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp4P35123 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp4P35123 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp4P35123 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp4P35123 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp4P35123 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp4P35123 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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