Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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