Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms