Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms