Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18529 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18529 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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