Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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