Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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